В колледже осуществляется многоуровневая система образования: довузовская подготовка (школа); подготовка дипломированного специалиста (вуз); послевузовское и дополнительное профессиональное образование - ординатура, аспирантура, докторантура, повышение квалификации, профессиональная подготовка и стажировка. В колледже функционируют пятнадцать учебно-экспериментальных лабораторий, оснащённых передовым инновационным оборудованием: физиологии; патфизиологии; микробиологии; гистологи и патанатомии; химии, физики и другие. Для проведения научных и экспериментальных работ Виварий, где обитают кролики, морские свинки, белые мыши и лягушки. Международный медицинский университет отвечает всем требованиям министерства образования и науки Кыргызской Республики.
